偏头痛的病因目前尚不清楚，但可能与下列因素有关：
(1)遗传因素，约60%的患者可问出家族史，部分病人家庭中可有癫痫病人，故认为该病与遗传有关，但尚无一致的遗传形式。
(2)内分泌因素，血管性偏头痛多见于青春期女性。更年期后逐渐减轻或消失，月经期发作频繁，妊娠时发作停止，分娩后再发，表明内分泌因素是导致本病病因之一。
(3)饮食因素，不少患者发作常与饮食有关，如经常食用奶酪、巧克力、刺激性食物、烟酒等均可产生血管性偏头痛。
(4)其他因素，情绪紧张、精神创伤、忧虑、焦虑、饥饿、失眠、外界环境差以及气候变化均可诱发偏头痛发作。